بر همين اساس به کمک قابليت هاي سامانه جامع گمرکي و پنجره واحد تجارت فرامرزي و کنترل کامل­ همه­ کالا ها از طريق اين سامانه ها، در صورتي که مسير اظهارنامه صادراتي کنترل سيستمي سطح يک (سبز) تعيين شود نيازي به ورود حامل‌ها به داخل گمرک مبدأ صادرات (به استثناء اظهارنامه‌هايي که گمرک مبدأ و مرز خروج يکسان باشد) و توزين والصاق پلمپ در گمرک مبدأ (داخلي) نيست.­
در مرحله ابتدايي، صاحب کالا يا اظهارکننده در کارتابل مربوطه در پنجره واحد تجارت فرامرزي، نسبت به ثبت صدور مجوز بارگيري، ثبت اطلاعات حامل، ثبت توزين، ثبت بيجک، مراحل درب خروج و بيجک بين اقدام مي‌کند.
در صورتي که مسير اظهارنامه صادراتي کنترل سيستمي سطح دو (زرد ) تعيين شود: نيازي به ورود حامل‌ها به داخل گمرک مبدأ صادرات (به استثناء اظهارنامه‌هايي که گمرک مبدأ و مرز خروج يکسان باشد) و توزين و الصاق پلمپ در گمرک مبدأ (داخلي) نيست.­
در اين مسير در ابتدا بررسي اسنادي اظهارنامه‌هاي کنترل سطح دو توسط گمرک مبدأ انجام مي‌پذيرد.
سپس صاحب کالا يا اظهارکننده در کارتابل مربوطه در پنجره واحد تجارت فرامرزي، با لحاظ کردن قفل سيستمي روي مجوزها نسبت به ثبت صدور مجوز بارگيري، ثبت اطلاعات حامل، ثبت توزين، ثبت بيجک، مراحل درب خروج و بيجک بين اقدام مي‌ کند، در صورت نياز به تعيين ماهيت و يا تغيير مسير وفق مقررات انجام شود.
در صورتي که مسير اظهارنامه صادراتي کنترل سيستمي سطح سه (قرمز) تعيين شود، اگر واحد بازرگاني و غيرتوليدي باشد، ابتدا توسط کارشناس مربوطه، نوع حمل از ارزيابي در محل به حمل يکسره يا قبض انبار (کالاهاي تعريف شده طي بخشنامه مربوطه) تغيير داده شود و موضوع با­­ اعلام نظر به صاحب کالا ارسال شود. سپس صاحب کالا نسبت به ثبت اطلاعات حامل و اطلاعات وزن در پنجره واحد تجارت اقدام و مابقي مراحل شامل ارزيابي و ثبت نظر ارزيابي، الصاق پلمب، باسکول، بيجک، مراحل درب خروج و بيجک بين در سامانه جامع گمرکي، توسط گمرک صورت مي‌گيرد. اما اگر واحد توليدي باشد، نيازي به ورود حامل‌ها به داخل گمرک مبدأ صادرات (به استثناء اظهارنامه‌هايي که گمرک مبدأ و مرز خروج يکسان باشد) و نيز نيازي به توزين در گمرک مبدأ (داخلي) نمي‌باشد. بعد از مراحل ارزيابي و ثبت نظر، الصاق پلمب و ثبت شماره پلمب در اعلام نظر در سامانه جامع، مراحل بعدي شامل ثبت صدور مجوز بارگيري (با لحاظ کردن قفل سيستمي روي مجوزها)، ثبت اطلاعات حامل، ثبت توزين، ثبت بيجک توسط صاحب کالا در کارتابل مربوطه و تا زمان سيستمي شدن ثبت شماره پلمب در پنجره واحد تجارت فرامرزي، مراحل درب خروج و بيجک بين در سامانه جامع گمرکي، توسط گمرک صورت مي‌پذيرد.